Placé sous l’autorité directe du chef d’état-major des armées (CEMA), le commandement de la cyberdéfense (COMCYBER) est un commandement opérationnel, qui rassemble l'ensemble des forces de cyberdéfense du ministère sous une autorité interarmées.

Créé en mai 2017 par décret, le COMCYBER a pour missions :

• La conduite de la défense des systèmes d’information pour prévenir, détecter et contrer les attaques visant le ministère des Armées ;
• La protection des systèmes d’information de la responsabilité du CEMA ;
• La conception, la planification et la conduite des opérations militaires dans le cyberespace avec des actions de LIO et de L2I ;
• La préparation opérationnelle des forces dans le domaine cyber, via des entraînements et exercices nationaux ou internationaux ;
• La cohérence du modèle de cyberdéfense et sa coordination générale (politique RH, besoins techniques, développement de doctrine) ;
• Le développement et l’animation de la réserve de cyberdéfense, opérationnelle et citoyenne.

Pour remplir ses missions le COMCYBER dispose de deux structures :

• D’un état-major de la cyberdéfense (EM-CYBER), inséré dans le pôle opérations de l'EMA ;
• Du groupement de la cyberdéfense des armées (GCA), situé à Rennes et en région parisienne.