Son année de spécialisation effectuée à l’École supérieure et d’application du matériel à Bourges, il sert au 6e bataillon du matériel de division légère blindée du 6e  régiment de commandement et de soutien, comme lieutenant chef de section de réparation détaché au 1er régiment étranger de cavalerie à Orange de 1990 à 1992. Il est aussitôt engagé dans le Golfe Persique au sein de la division Daguet puis l’année suivante au sein des Éléments français d’assistance opérationnelle en République centrafricaine. Officier adjoint en 1992, il est projeté au Tchad au sein de l’opération Épervier puis en Ex-Yougoslavie comme chef des services techniques du bataillon d’infanterie n°4 et commandant de l’unité de soutien. Il est promu capitaine le 1er  août 1993.

De 1994 à 1996, il commande la 1re compagnie de maintenance mobilité du 6e bataillon du matériel de division légère blindée à Nîmes et participe avec son unité à deux opérations successives en Ex-Yougoslavie au sein du bataillon d’infanterie n°2.

Muté en 1996, il rejoint la direction du personnel militaire de l’armée de Terre à Paris en tant que rédacteur au bureau contingent. Il est promu commandant le 1er octobre 1999.

Reçu au concours de l’enseignement militaire supérieur du second degré, il suit entre 2001 et 2002 la scolarité de la 114e promotion du cours supérieur d’état-major puis de la 9e promotion du collège interarmées de défense.

Le 1er septembre 2002, il rejoint le 1er régiment du Matériel à Laon-Couvron où il prend les fonctions de chef du bureau maintenance opérations instruction. Promu lieutenant-colonel en 2003, il participe à l’opération Licorne en République de Côte d’Ivoire comme chef du détachement logistique. À son retour, il prend le poste de commandant en second du régiment. Début 2005, il est projeté en Indonésie au sein de l’opération Béryx comme chef de la cellule logistique Terre puis adjoint du chef du centre de désengagement opérationnel.

À l’été 2005, il intègre le cours supérieur d’état-major à Paris en qualité de professeur.

Affecté à Nîmes, il prend le commandement du 4e régiment du matériel le 2 juillet 2008. Promu colonel le 1er octobre de la même année, il participe avec son régiment à l’opération Pamir en Afghanistan. Chef de corps du bataillon  logistique n°4, il est cité à l’ordre du régiment avec attribution de la médaille d’or de la défense nationale. Il achève son TC le 23 juillet 2010.

Dès le lendemain, il rejoint Lille et prend les fonctions de chef du bureau équipement au sein du commandement des forces terrestres.

À l’été 2012, il est affecté à la Structure intégrée du maintien en condition opérationnelle des matériels terrestres (SIMMT) à Versailles en qualité d’adjoint au chef de la division des parcs.

Le 1er juillet 2013, il devient le chef du bureau "maintien en condition opérationnelle de l’état-major de l’armée de Terre", À partir du 1er août 2016, il participe comme adjoint au commandant de la maintenance des forces à la création et la montée en puissance de ce commandement depuis le poste avancé de Satory. Il est nommé général de brigade le 1er avril 2017.

A l’été 2018, il prend les fonctions de directeur adjoint du service de la maintenance industrielle terrestre (SMITER) à Versailles.

Le 1er juillet 2019, il prend les fonctions d’adjoint performance synthèse au directeur central de la SIMMT.

Nommé général de division le 1er août 2020, il prend le commandement de la maintenance des forces terrestres à Lille.

Titulaire d’une citation à l’ordre de la division avec attribution de la croix de guerre des théâtres d’opérations extérieures, le général de division Patrice Janvier est officier dans l’ordre de la Légion d’honneur et l’ordre national du Mérite.

Marié, il est père de cinq enfants.