L'aviso Commandant Bouan et le patrouilleur de service public Arago participent actuellement à la campagne de contrôle de la pêche au thon rouge dans le canal de Sicile. Ce dispositif est complété par un avion de surveillance maritime Falcon 50 .
Le contrôle de la pêche au thon rouge est coordonné par les Affaires maritimes. Les inspecteurs des affaires maritimes sont embarqués sur le Commandant Bouan puis sur l' Arago. Les moyens hauturiers et aériens de la marine nationale permettent de contrôler les senneurs français et européens présents sur zone.
La pêche au thon revêt un aspect particulier. Une fois le banc de thon repéré, il est encerclé par la senne. Le thon ainsi capturé reste dans la senne jusqu'à l'arrivée d'un remorqueur tractant une cage sous-marine. Une fois le transfert des thons de la senne à la cage réalisé, la cage est tractée vers les fermes d'élevage. Les contrôles sont réalisés au moment du transfert du banc vers la cage car ils permettent de s'assurer du respect des quotas.
Ces contrôles, d'une pêche très sensible ouverte un mois dans l'année, garantissent une pêche responsable et en accord avec la réglementation.