Las misiones humanitarias del SSA se dividen esencialmente en dos tipos: el socorro de emergencia tras el surgimiento de catástrofes y la ayuda médica a poblaciones víctimas de conflictos. En dicho caso, se pueden atribuir medios médico-quirúrgicos, adaptados a las situaciones de emergencia, a dichas misiones: puesto de socorro, antena médico-quirúrgica, sección de hospitalización.
Durante las operaciones exteriores, el SSA aporta, dentro del límite de su acción de apoyo a las fuerzas, una ayuda médica a las poblaciones.