L'escadron de transport, d'entraînement et de calibration 00.065 trouve ses origines dans le groupe aérien d'entraînement et de liaison 87 (GAEL) créé en juillet 1945 sur le terrain du Bourget. Le groupe, doté de Morane 500, de Goéland et de Nord 1000, fait mouvement sur Villacoublay dès l'année suivante.
En octobre 1946, il devient le deuxième escadron de la nouvelle 60ème escadre de transport, le célèbre GLAM en étant alors GTLA 2/60. Les années 50 voient l'arrivée d'un grand nombre de Flamant, puis de Beech 45, de MH 1521 Broussard et de Dakota lors de la décennie suivante. Entre-temps, en 1959, l'unité reçoit son premier appareil à réaction, le MS 760 Paris.
Puis, à partir de 1968, apparaît le Nord 262. L'importance de l'unité justifie alors sa scission en deux escadrilles à partir de 1969, la première rassemblant tous les Nord 262. Le 6 juillet 1972, est créé la 65ème escadre de transport, composée de deux escadrons : l'ET 1/65 « VENDOME », qui regroupe les Mystère XX nouvellement perçus et les Nord 262, et l'ET 2/65 « RAMBOUILLET », doté de MH 1521 Broussard et de MS 760 Paris. En 1984, la 6ème ET s'enrichit d'une troisième unité, l'escadron de calibration 3/65, doté également de Mystère XX. L'année 86 voit l'arrivée au GAEL d'un nouvel appareil, le DHC 6 Twin-Otter, dont un est détaché à Berlin, et un autre dans le Sinaï dans le cadre de la mission MFO.
L'année suivante, tandis que le Broussard quitte le service actif, l'EC 3/65 devient l'escadron de transport et de calibration, regroupant tous les Mystère XX, avant d'être dissous en mai 1991. A ce moment, en effet, les trois unités laissent la place à un unique escadron, l'ETEC 00.065 (escadron de transport, d'entraînement et de calibration), mais pour tous il reste connu sous le nom de « GAEL ». L'année 1992 est marquée par l'arrivée des premiers monomoteurs TBM 700. Un nouveau changement important intervient en juillet 1995, lors de la dissolution du Groupe de liaison aérienne ministérielle. En effet, à compter de cette date, l'ETEC 65 hérite des deux Falcon 900 et des trois Mystère 50 de l'unité dissoute, et reprend à son compte la mission de transport « VIP ».
En 2002, l’ETEC 65 est doté de deux A319 CJ au profit des Hautes Autorités
Gouvernementales.
Deux ans plus tard, les Nord 262 sont retirés du service. En 2005, la composante Super Puma est réintégrée. Le 27 avril 2007 le dernier Mystère 20 encore utilisé pour la calibration des bases aériennes et aéronavales quitte l’escadron.